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蛋白質(zhì)組研究:生命天書(shū)的新解碼?

前不久,《自然》雜志在線發(fā)表了中國(guó)科學(xué)家在早期肝細(xì)胞癌蛋白質(zhì)組研究領(lǐng)域取得的重大科研成果。這一研究測(cè)定了早期肝細(xì)胞癌的蛋白質(zhì)組表達(dá)譜和磷酸化蛋白質(zhì)組圖譜,發(fā)現(xiàn)了肝細(xì)胞癌精準(zhǔn)治療的潛在新靶點(diǎn)——膽固醇酯化酶SOAT1。

90%以上的肝癌屬于肝細(xì)胞癌。對(duì)于普通人來(lái)說(shuō),這一研究最耀眼的成績(jī),是給治療最兇險(xiǎn)的一類(lèi)肝細(xì)胞癌帶來(lái)了希望;對(duì)于蛋白質(zhì)組相關(guān)科研人員來(lái)說(shuō),這一成果是“中國(guó)人類(lèi)蛋白質(zhì)組計(jì)劃迎來(lái)的第一道曙光”。

該成果論文的通訊作者、國(guó)家蛋白質(zhì)科學(xué)中心(北京)首席科學(xué)家賀福初院士認(rèn)為:“這一成果證明,基因組學(xué)不能獨(dú)打天下,現(xiàn)在輪到蛋白質(zhì)組學(xué)上場(chǎng)了。”

回顧此前有關(guān)癌癥的研究成果,“基因”這個(gè)詞是在抗癌場(chǎng)景中出現(xiàn)的高頻詞——科學(xué)家相信:人類(lèi)的某些基因隱藏著打開(kāi)癌癥開(kāi)關(guān)的鑰匙。這一思路符合學(xué)界對(duì)基因組學(xué)的一貫期待,賀福初院士介紹:“人們1985年開(kāi)始醞釀基因組計(jì)劃的主要?jiǎng)恿Γ褪窍M軌蛲ㄟ^(guò)描繪和破解基因藍(lán)圖,揭示人類(lèi)生老病死的規(guī)律和本質(zhì)。”

但人們將基因圖譜這本“天書(shū)”印出來(lái)后,發(fā)現(xiàn)解讀“天書(shū)”依舊是一大難題。

1994年澳大利亞科學(xué)家Marc Wikins首先提出蛋白質(zhì)組學(xué)這一概念。簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō),基因承載著人類(lèi)的遺傳物質(zhì),而蛋白質(zhì)是遺傳物質(zhì)傳遞的最后一個(gè)環(huán)節(jié),是生命活動(dòng)的執(zhí)行者,蛋白質(zhì)是組成人體所有細(xì)胞和組織的重要成分。一個(gè)生物系統(tǒng)在特定狀態(tài)下表達(dá)的所有種類(lèi)的蛋白質(zhì)就是蛋白質(zhì)組。

1998年,“認(rèn)為基因組學(xué)的發(fā)展或許遇到了瓶頸”的賀福初開(kāi)始轉(zhuǎn)向蛋白質(zhì)組學(xué)研究。2002年,賀福初成為“國(guó)際人類(lèi)蛋白質(zhì)組計(jì)劃”的重要參與者,并帶領(lǐng)中國(guó)科學(xué)家牽頭實(shí)施人類(lèi)肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃,他相信“基因組學(xué)解決不了的問(wèn)題,或許蛋白質(zhì)組學(xué)能解決”。

目前賀福初團(tuán)隊(duì)的研究思路與一些美國(guó)同行不同。據(jù)介紹,賀福初團(tuán)隊(duì)的思路是用蛋白質(zhì)組學(xué)驅(qū)動(dòng)的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)“領(lǐng)跑”國(guó)際精準(zhǔn)醫(yī)療;而美國(guó)的研究主流策略是“蛋白基因組學(xué)”,即將蛋白質(zhì)組的數(shù)據(jù)用于基因組的注釋?zhuān)鞍踪|(zhì)組的研究仍然需要“背靠”基因組、轉(zhuǎn)錄組。

科學(xué)家們對(duì)蛋白質(zhì)組學(xué)研究的價(jià)值存在爭(zhēng)議。賀福初說(shuō),學(xué)界更為主流的觀點(diǎn)是,蛋白質(zhì)組學(xué)的研究只是基因組學(xué)研究的“注解”。

而賀福初認(rèn)為蛋白組研究不是基因組研究的“附庸”。以本次發(fā)表在《自然》雜志在線的研究為例,他希望更多人認(rèn)同蛋白質(zhì)組研究的價(jià)值和作用。

賀福初團(tuán)隊(duì)的這項(xiàng)研究持續(xù)了5年。研究發(fā)現(xiàn),在最兇險(xiǎn)的一類(lèi)肝細(xì)胞癌中,膽固醇穩(wěn)態(tài)失調(diào)與病發(fā)有直接聯(lián)系,具體來(lái)說(shuō),膽固醇酯化酶越活躍,這類(lèi)患者的手術(shù)后復(fù)發(fā)或死亡風(fēng)險(xiǎn)越大。而如果膽固醇酯化酶SOAT1得到抑制,腫瘤的增殖和遷移能力也同時(shí)受到有效抑制。他們的研究還發(fā)現(xiàn),膽固醇酯化酶SOAT1在頭頸癌、胃癌、前列腺癌、腎癌和甲狀腺癌中均和患者較差的術(shù)后轉(zhuǎn)移和死亡表現(xiàn)正相關(guān)。

賀福初認(rèn)為,這種基于蛋白質(zhì)組研究的“抗代謝失穩(wěn)”的抗癌思路,或可成為繼抗增殖抗癌療法和免疫抑制抗癌療法之后的抗癌新方向。

在前不久舉行的成果發(fā)布會(huì)上,施普林格 自然旗下自然科研大中華區(qū)總監(jiān)保羅 埃文斯在祝賀視頻中說(shuō):“《自然》雜志約有93%的拒稿率,因此這樣一篇論文發(fā)表出來(lái)是一項(xiàng)很大的成就,我深信這項(xiàng)研究工作將為蛋白質(zhì)組學(xué)所引導(dǎo)的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的發(fā)展作出有力貢獻(xiàn)。”

“蛋白組是解讀生命天書(shū)的利器。”該成果的第一作者、軍事科學(xué)院軍事醫(yī)學(xué)研究院研究員姜穎相信:“蛋白質(zhì)組學(xué)驅(qū)動(dòng)的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)時(shí)代正向我們走來(lái)。”

據(jù)悉,此前在“蛋白基因組學(xué)”研究模式的指導(dǎo)下,美國(guó)等國(guó)的科學(xué)家們已經(jīng)完成的精準(zhǔn)醫(yī)療分子分型包括:結(jié)直腸癌、乳腺癌、卵巢癌和胃癌等。

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