香港行 探訪香港村
2023-08-04 02:15:31
原位化學交聯可以解碼細胞中蛋白質動態結構策略
2023-08-04 02:15:31 來源: 中國科學報
(資料圖片僅供參考)
近日，中國科學院大連化學物理研究所研究員趙群和研究員張麗華等與中國科學院精密測量科學技術創新研究院副研究員龔洲合作，提出了利用原位化學交聯—質譜技術，解碼細胞中蛋白質動態結構的策略。
該策略將AlphaFold2的結構作為先驗信息，結合in vivo XL-MS數據與多種結構計算方法評估結構與交聯信息的匹配度，重構了細胞內多種蛋白質，尤其是多結構域蛋白質和固有無序蛋白質（IDP）的原位動態結構，為深入研究蛋白質在細胞微環境中發揮功能的分子機制提供技術支撐。相關成果發表在《德國應用化學》上。
活細胞內蛋白質的原位動態結構對于揭示其生物學功能至關重要。隨著深度學習算法助力蛋白質結構預測的發展迭代，AlphaFold2實現了對蛋白質結構的全面預測，然而該方法對柔性區域的結構預測仍面臨挑戰。近年來，in vivo XL-MS以高通量、高靈敏，且對蛋白質純度要求低等優勢，在解析活細胞內蛋白質的原位動態結構方面展示出重要潛力。
本工作中，針對多結構域蛋白質，研究團隊提出了將結構域作為整體，利用結構域間的XL-MS數據對細胞內蛋白質動態結構建模，實現了三種多結構域蛋白質——鈣調蛋白、hnRNP A1和hnRNP D0在細胞內的動態結構表征。此外，針對IDP，研究團隊提出了兩種互補的結構表征策略：一是將XL-MS信息直接轉換為距離約束用于IDP的結構計算，二是首先使用全原子分子動力學模擬進行無偏采樣，然后基于XL-MS數據對采樣結構進行評估和篩選。利用這兩種策略，研究團隊解碼了高遷移率組蛋白HMG-I/Y和HMG-17在細胞內的動態系綜構象。
相關論文信息：https://doi.org/10.1002/anie.202301345
關鍵詞：
您可能也感興趣:
為您推薦
順豐18個月內擇機登陸H股 業務資本雙出海國際化戰略再加力
2023-08-04 02:15:31
上海一寧文化傳播有限公司創始人聶婉縈
2023-08-04 02:15:31
京新藥業：目前地達西尼的審評工作正常有序進行，說明書審核是其中的一個步驟
2023-08-04 02:15:31
排行
最近更新
- 原位化學交聯可以解碼細胞中蛋白質動態結構策略
- 研究重點產業鏈培育工作
- 射擊10米氣步槍混合團體冠軍宋布寒、張雨：最重要的是做好自己
- 河北涿州：高新技術產業開發區積水區域 救援持續進行中
- 超強臺風“卡努”將至，或現“急轉彎”走位！山東將有大范圍降水
- 國網瑞安市供電公司：遷移電桿 提升山區電網防臺防汛能力
- 大跳水！下重手加倉！5份！
- 沈陽：1-6月全市GDP為3725.8億元 房地產開發投資同比降26.0%
- 奧園健康：已達成所有復牌指引，公司股票8月2日復牌
- 梅西代言醬酒？酒企：是真的！品牌方背后是這家A股
- 白鷺舞蹁躚 鄉村美如畫
- 興銀理財占據上半年ESG理財業績榜單半壁江山 榜首產品凈值增...
- 證券板塊午后持續走強，財達證券、華林證券雙雙漲停
- 涿州應急救援隊 曝河北涿州救援卡在“邀請函”上 基本情況講解
- 華翔股份: 關于IPO募投項目結項后節余資金永久補充流動資金...
- 特斯拉神秘部門曝光：專門處理續航不足投訴，虛標得到CEO首肯
- 有關谷歌AI設計芯片的激烈分歧
- 張進才：讓人費解的依法、有序降低房貸利率
- 張子楓變美，不止是因為瘦了
- 夏天喝酸梅湯，好處遠遠不止是解暑消熱，還有4個好處不妨多了解
- 摩納哥面積多大（摩納哥面積）
- 張藝謀《堅如磐石》定檔：于和偉、張國立等主演！
- 北京：本次降雨為140年來最大降雨
- 北京強降雨已致11人遇難
- 中南大學教育關愛暑期社會實踐正式授牌開營
- 現貨黃金交易提醒：惠譽下調美國信用評級，時隔12年的“輪回...
- 傳媒行業跟蹤報告：基金重倉低配比例縮減，游戲板塊持續受到青睞
- 金蝶國際(00268.HK)8月17日舉行董事會會議審議并批準中期業績
- 國內商品期貨早盤開盤 尿素跌超4%
- 因貸款“三查”不盡職，新疆和靜縣農村信用合作聯社被罰30萬...